在传统的植物学研究中，受实验手段所限只能研究植物表型在某一个时间截面时的静止状态，反映的是该时间点以前全部生物学动态过程的累积效应。然而植物的生长发育是一系列时间—空间特异的过程的组合，只有观察动态变化过程才能更好地认识植物生长发育调控的时空特异性。而且随着植物科学的发展，越来越多的研究人员需要在活体植株中验证基因的功能，研究基因的表达调控，以及植物的昼夜节律等，因此，对于植物活体成像的需求也越来越大，还可以应用于植物阳性克隆的筛选以及转基因植物的鉴定等多方面。

　　植物活体成像可应用于植株，叶片，种子，愈伤组织等荧光和生物发光成像，可同时显示多个报告基因，满足不同荧光探针的检测需求，如GFP， RFP及红外染料等，尤其适用于植株体内Luc报告基因的检测。

　　植物基因表达和蛋白质互作研究、抗逆性研究、基因胁迫实验、生长规律及节律监测、克隆筛选、基因育种筛选、叶绿素监测、药用植物筛选以及植物细菌和病毒感染研究等。

　　植物基因表达和蛋白质互作研究

　　植物的基因表达受到温度、光照等因素调节，能够直接反映植物基因表达的空间和时间分布，进而了解体内特异性基因与受体相互作用和信号转导途径等生物学过程。

　　叶绿素监测，对植物体中叶绿素进行定性和定量测定来估算植物的生长状况及分布，可作为植物和环境质量评估的指标。

　　植物生物节律及光周期相关研究，生物节律是一种生物内在的、复杂而精细的生理调节系统，它使植物得以根据外界环境的周期性变化来协调自身新陈代谢及各种生理过程，从而与环境保持同步。